Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtskP55097 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtskP55097 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtskP55097 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CtskP55097 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtskP55097 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtskP55097 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtskP55097 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtskP55097 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtskP55097 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CtskP55097 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtskP55097 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtskP55097 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtskP55097 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CtskP55097 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtskP55097 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CtskP55097 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CtskP55097 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtskP55097 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtskP55097 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtskP55097 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtskP55097 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtskP55097 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CtskP55097 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtskP55097 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtskP55097 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtskP55097 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtskP55097 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtskP55097 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtskP55097 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CtskP55097 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CtskP55097 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtskP55097 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtskP55097 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtskP55097 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CtskP55097 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtskP55097 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtskP55097 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtskP55097 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtskP55097 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtskP55097 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtskP55097 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CtskP55097 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtskP55097 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtskP55097 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtskP55097 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtskP55097 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtskP55097 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtskP55097 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtskP55097 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtskP55097 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CtskP55097 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtskP55097 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtskP55097 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtskP55097 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtskP55097 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtskP55097 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtskP55097 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtskP55097 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtskP55097 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtskP55097 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CtskP55097 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtskP55097 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CtskP55097 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtskP55097 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtskP55097 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtskP55097 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtskP55097 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtskP55097 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtskP55097 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtskP55097 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtskP55097 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CtskP55097 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CtskP55097 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms