Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc12a1P55014 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc12a1P55014 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc12a1P55014 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc12a1P55014 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc12a1P55014 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc12a1P55014 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc12a1P55014 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc12a1P55014 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc12a1P55014 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc12a1P55014 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc12a1P55014 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc12a1P55014 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms