Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PctpP53808 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PctpP53808 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PctpP53808 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PctpP53808 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PctpP53808 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PctpP53808 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PctpP53808 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PctpP53808 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PctpP53808 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PctpP53808 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PctpP53808 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PctpP53808 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PctpP53808 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PctpP53808 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PctpP53808 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PctpP53808 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PctpP53808 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PctpP53808 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PctpP53808 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PctpP53808 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PctpP53808 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PctpP53808 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PctpP53808 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PctpP53808 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PctpP53808 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PctpP53808 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PctpP53808 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PctpP53808 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PctpP53808 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PctpP53808 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PctpP53808 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PctpP53808 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PctpP53808 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PctpP53808 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PctpP53808 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PctpP53808 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PctpP53808 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PctpP53808 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PctpP53808 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PctpP53808 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PctpP53808 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PctpP53808 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PctpP53808 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PctpP53808 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PctpP53808 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PctpP53808 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PctpP53808 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PctpP53808 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PctpP53808 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PctpP53808 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PctpP53808 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PctpP53808 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PctpP53808 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PctpP53808 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PctpP53808 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PctpP53808 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PctpP53808 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PctpP53808 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PctpP53808 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PctpP53808 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PctpP53808 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PctpP53808 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PctpP53808 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms