Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fdft1P53798 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fdft1P53798 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms