Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cux1P53564 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux1P53564 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cux1P53564 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cux1P53564 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cux1P53564 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux1P53564 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux1P53564 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.33
Cux1P53564 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux1P53564 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux1P53564 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux1P53564 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux1P53564 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cux1P53564 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cux1P53564 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cux1P53564 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms