Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Map3k1P53349 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Map3k1P53349 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Map3k1P53349 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms