Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Efnb1P52795 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms