Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ClgnP52194 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ClgnP52194 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClgnP52194 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClgnP52194 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClgnP52194 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClgnP52194 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClgnP52194 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms