Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApodP51910 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ApodP51910 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApodP51910 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApodP51910 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApodP51910 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApodP51910 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApodP51910 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApodP51910 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApodP51910 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApodP51910 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApodP51910 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApodP51910 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ApodP51910 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApodP51910 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ApodP51910 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApodP51910 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApodP51910 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApodP51910 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApodP51910 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ApodP51910 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApodP51910 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApodP51910 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApodP51910 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ApodP51910 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApodP51910 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApodP51910 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApodP51910 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApodP51910 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApodP51910 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApodP51910 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApodP51910 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ApodP51910 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ApodP51910 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApodP51910 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApodP51910 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApodP51910 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApodP51910 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApodP51910 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApodP51910 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ApodP51910 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApodP51910 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApodP51910 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApodP51910 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ApodP51910 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ApodP51910 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApodP51910 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApodP51910 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApodP51910 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApodP51910 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApodP51910 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApodP51910 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApodP51910 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApodP51910 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApodP51910 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApodP51910 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApodP51910 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ApodP51910 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApodP51910 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApodP51910 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApodP51910 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApodP51910 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApodP51910 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApodP51910 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApodP51910 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApodP51910 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApodP51910 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApodP51910 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApodP51910 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApodP51910 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ApodP51910 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ApodP51910 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApodP51910 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApodP51910 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApodP51910 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApodP51910 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApodP51910 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApodP51910 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ApodP51910 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApodP51910 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApodP51910 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ApodP51910 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ApodP51910 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ApodP51910 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms