Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LumP51885 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LumP51885 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LumP51885 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LumP51885 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LumP51885 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LumP51885 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LumP51885 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LumP51885 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LumP51885 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LumP51885 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LumP51885 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LumP51885 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LumP51885 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LumP51885 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LumP51885 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LumP51885 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LumP51885 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LumP51885 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LumP51885 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LumP51885 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LumP51885 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LumP51885 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LumP51885 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LumP51885 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LumP51885 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LumP51885 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LumP51885 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LumP51885 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LumP51885 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LumP51885 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LumP51885 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LumP51885 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LumP51885 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LumP51885 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LumP51885 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LumP51885 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LumP51885 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LumP51885 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LumP51885 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LumP51885 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LumP51885 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LumP51885 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LumP51885 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LumP51885 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LumP51885 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LumP51885 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LumP51885 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LumP51885 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LumP51885 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LumP51885 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LumP51885 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LumP51885 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LumP51885 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LumP51885 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LumP51885 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LumP51885 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LumP51885 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LumP51885 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LumP51885 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LumP51885 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LumP51885 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LumP51885 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LumP51885 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LumP51885 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LumP51885 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LumP51885 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LumP51885 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LumP51885 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LumP51885 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LumP51885 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LumP51885 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LumP51885 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LumP51885 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LumP51885 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LumP51885 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LumP51885 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LumP51885 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LumP51885 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LumP51885 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LumP51885 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LumP51885 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LumP51885 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LumP51885 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LumP51885 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LumP51885 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LumP51885 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LumP51885 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LumP51885 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LumP51885 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LumP51885 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LumP51885 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LumP51885 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LumP51885 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LumP51885 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LumP51885 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LumP51885 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LumP51885 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LumP51885 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LumP51885 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms