Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tnni3P48787 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnni3P48787 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms