Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptx3P48759 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ptx3P48759 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms