Protein–RNA interactions for Protein: P48744

Ndp, Norrin, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdpP48744 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdpP48744 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdpP48744 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdpP48744 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdpP48744 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdpP48744 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdpP48744 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdpP48744 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdpP48744 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdpP48744 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdpP48744 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NdpP48744 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NdpP48744 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NdpP48744 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NdpP48744 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NdpP48744 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NdpP48744 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NdpP48744 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NdpP48744 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NdpP48744 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NdpP48744 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NdpP48744 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NdpP48744 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NdpP48744 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdpP48744 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NdpP48744 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NdpP48744 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NdpP48744 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdpP48744 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdpP48744 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms