Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp1P47955 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp1P47955 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp1P47955 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp1P47955 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp1P47955 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp1P47955 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp1P47955 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp1P47955 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rplp1P47955 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rplp1P47955 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rplp1P47955 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rplp1P47955 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rplp1P47955 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rplp1P47955 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms