Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl29P47915 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl29P47915 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms