Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf4P43488 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf4P43488 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms