Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Csf3rP40223 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Csf3rP40223 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms