Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxc11P31313 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxc11P31313 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms