Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctnnd1P30999 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctnnd1P30999 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms