Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vcam1P29533 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vcam1P29533 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vcam1P29533 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms