Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NapbP28663 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NapbP28663 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NapbP28663 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NapbP28663 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NapbP28663 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NapbP28663 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NapbP28663 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NapbP28663 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NapbP28663 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NapbP28663 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NapbP28663 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NapbP28663 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NapbP28663 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NapbP28663 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NapbP28663 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapbP28663 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapbP28663 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapbP28663 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapbP28663 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapbP28663 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapbP28663 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapbP28663 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapbP28663 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapbP28663 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NapbP28663 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapbP28663 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NapbP28663 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NapbP28663 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NapbP28663 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NapbP28663 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NapbP28663 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NapbP28663 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NapbP28663 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NapbP28663 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NapbP28663 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NapbP28663 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NapbP28663 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NapbP28663 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NapbP28663 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NapbP28663 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NapbP28663 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapbP28663 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapbP28663 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapbP28663 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapbP28663 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapbP28663 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapbP28663 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapbP28663 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapbP28663 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapbP28663 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapbP28663 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapbP28663 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapbP28663 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapbP28663 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NapbP28663 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapbP28663 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapbP28663 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapbP28663 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapbP28663 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapbP28663 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapbP28663 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NapbP28663 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NapbP28663 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NapbP28663 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NapbP28663 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NapbP28663 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NapbP28663 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms