Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Etv4P28322 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Etv4P28322 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Etv4P28322 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Etv4P28322 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Etv4P28322 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Etv4P28322 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Etv4P28322 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Etv4P28322 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Etv4P28322 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Etv4P28322 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Etv4P28322 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms