Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gjc1P28229 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjc1P28229 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms