Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PdgfraP26618 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PdgfraP26618 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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