Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CftrP26361 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CftrP26361 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CftrP26361 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CftrP26361 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CftrP26361 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CftrP26361 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CftrP26361 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CftrP26361 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CftrP26361 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CftrP26361 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CftrP26361 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CftrP26361 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CftrP26361 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CftrP26361 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CftrP26361 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CftrP26361 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CftrP26361 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CftrP26361 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CftrP26361 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CftrP26361 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CftrP26361 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CftrP26361 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
CftrP26361 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CftrP26361 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CftrP26361 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CftrP26361 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CftrP26361 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
CftrP26361 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CftrP26361 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CftrP26361 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CftrP26361 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
CftrP26361 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CftrP26361 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CftrP26361 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CftrP26361 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CftrP26361 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CftrP26361 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CftrP26361 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CftrP26361 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CftrP26361 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CftrP26361 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CftrP26361 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CftrP26361 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CftrP26361 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CftrP26361 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CftrP26361 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CftrP26361 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CftrP26361 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CftrP26361 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CftrP26361 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CftrP26361 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CftrP26361 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CftrP26361 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CftrP26361 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CftrP26361 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CftrP26361 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CftrP26361 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CftrP26361 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CftrP26361 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CftrP26361 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CftrP26361 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CftrP26361 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CftrP26361 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CftrP26361 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CftrP26361 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CftrP26361 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CftrP26361 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CftrP26361 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CftrP26361 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CftrP26361 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CftrP26361 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CftrP26361 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CftrP26361 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CftrP26361 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CftrP26361 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CftrP26361 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CftrP26361 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CftrP26361 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CftrP26361 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CftrP26361 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CftrP26361 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CftrP26361 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CftrP26361 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CftrP26361 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CftrP26361 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
CftrP26361 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CftrP26361 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CftrP26361 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CftrP26361 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CftrP26361 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CftrP26361 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CftrP26361 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CftrP26361 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CftrP26361 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CftrP26361 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CftrP26361 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CftrP26361 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CftrP26361 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CftrP26361 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms