Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Itgb7P26011 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb7P26011 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Itgb7P26011 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itgb7P26011 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itgb7P26011 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb7P26011 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb7P26011 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb7P26011 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Itgb7P26011 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Itgb7P26011 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb7P26011 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb7P26011 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb7P26011 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb7P26011 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb7P26011 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb7P26011 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb7P26011 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb7P26011 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb7P26011 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb7P26011 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb7P26011 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb7P26011 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Itgb7P26011 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb7P26011 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb7P26011 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb7P26011 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb7P26011 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb7P26011 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb7P26011 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb7P26011 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb7P26011 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb7P26011 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb7P26011 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb7P26011 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb7P26011 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb7P26011 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb7P26011 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb7P26011 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb7P26011 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb7P26011 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb7P26011 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb7P26011 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb7P26011 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb7P26011 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb7P26011 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb7P26011 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itgb7P26011 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Itgb7P26011 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb7P26011 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb7P26011 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb7P26011 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb7P26011 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms