Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pou2f1P25425 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pou2f1P25425 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms