Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col8a2P25318 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Col8a2P25318 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms