Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdk11bP24788 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdk11bP24788 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdk11bP24788 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms