Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Htr3aP23979 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htr3aP23979 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms