Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Ccl20-203ENSMUST00000186832 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd11P23813 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm7714-201ENSMUST00000169154 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd11P23813 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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