Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcb1aP21447 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcb1aP21447 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcb1aP21447 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcb1aP21447 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcb1aP21447 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcb1aP21447 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcb1aP21447 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Abcb1aP21447 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Abcb1aP21447 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Abcb1aP21447 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcb1aP21447 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcb1aP21447 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcb1aP21447 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcb1aP21447 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcb1aP21447 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcb1aP21447 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Abcb1aP21447 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms