Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ms4a2P20490 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ms4a2P20490 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms