Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fcer1aP20489 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fcer1aP20489 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms