Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefhP19246 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefhP19246 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefhP19246 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefhP19246 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefhP19246 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefhP19246 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NefhP19246 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefhP19246 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefhP19246 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefhP19246 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefhP19246 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefhP19246 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefhP19246 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NefhP19246 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NefhP19246 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefhP19246 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefhP19246 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefhP19246 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefhP19246 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NefhP19246 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NefhP19246 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NefhP19246 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefhP19246 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefhP19246 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefhP19246 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefhP19246 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefhP19246 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NefhP19246 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefhP19246 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefhP19246 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefhP19246 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefhP19246 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefhP19246 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefhP19246 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefhP19246 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NefhP19246 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefhP19246 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefhP19246 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefhP19246 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NefhP19246 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NefhP19246 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefhP19246 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefhP19246 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefhP19246 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefhP19246 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NefhP19246 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NefhP19246 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefhP19246 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefhP19246 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NefhP19246 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NefhP19246 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefhP19246 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefhP19246 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefhP19246 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NefhP19246 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NefhP19246 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefhP19246 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefhP19246 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefhP19246 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NefhP19246 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefhP19246 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefhP19246 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefhP19246 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefhP19246 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefhP19246 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefhP19246 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefhP19246 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefhP19246 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefhP19246 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NefhP19246 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefhP19246 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefhP19246 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefhP19246 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefhP19246 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefhP19246 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NefhP19246 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefhP19246 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NefhP19246 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms