Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ifrd1P19182 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ifrd1P19182 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms