Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Tnnc1P19123 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tnnc1P19123 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms