Protein–RNA interactions for Protein: P18419

Svs4, Seminal vesicle secretory protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs4P18419 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Svs4P18419 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Svs4P18419 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Svs4P18419 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Svs4P18419 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Svs4P18419 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Svs4P18419 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms