Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp53P15975 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp53P15975 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp53P15975 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp53P15975 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp53P15975 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp53P15975 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms