Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd5P13379 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms