Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApcsP12246 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ApcsP12246 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ApcsP12246 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms