Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dnmt3cP0DOY1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnmt3cP0DOY1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms