Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ndufb1P0DN34 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ndufb1P0DN34 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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