Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb2P0C1T1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hoxb2P0C1T1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms