Protein–RNA interactions for Protein: P09542

Myl3, Myosin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl3P09542 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myl3P09542 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myl3P09542 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myl3P09542 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myl3P09542 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myl3P09542 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myl3P09542 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myl3P09542 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myl3P09542 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl3P09542 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl3P09542 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl3P09542 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myl3P09542 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myl3P09542 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myl3P09542 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl3P09542 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl3P09542 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl3P09542 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl3P09542 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl3P09542 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl3P09542 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl3P09542 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myl3P09542 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myl3P09542 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myl3P09542 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms