Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NeflP08551 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NeflP08551 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NeflP08551 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NeflP08551 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NeflP08551 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NeflP08551 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NeflP08551 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NeflP08551 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NeflP08551 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NeflP08551 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NeflP08551 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NeflP08551 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NeflP08551 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NeflP08551 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NeflP08551 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NeflP08551 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NeflP08551 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NeflP08551 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NeflP08551 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NeflP08551 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NeflP08551 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NeflP08551 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NeflP08551 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NeflP08551 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NeflP08551 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NeflP08551 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NeflP08551 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NeflP08551 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NeflP08551 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NeflP08551 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NeflP08551 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NeflP08551 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NeflP08551 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NeflP08551 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NeflP08551 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NeflP08551 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NeflP08551 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NeflP08551 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NeflP08551 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NeflP08551 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NeflP08551 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NeflP08551 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NeflP08551 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NeflP08551 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NeflP08551 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NeflP08551 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NeflP08551 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NeflP08551 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NeflP08551 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NeflP08551 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NeflP08551 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NeflP08551 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NeflP08551 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NeflP08551 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NeflP08551 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NeflP08551 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NeflP08551 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NeflP08551 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NeflP08551 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NeflP08551 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NeflP08551 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NeflP08551 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NeflP08551 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NeflP08551 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NeflP08551 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NeflP08551 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NeflP08551 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NeflP08551 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NeflP08551 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeflP08551 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeflP08551 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeflP08551 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeflP08551 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NeflP08551 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeflP08551 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeflP08551 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeflP08551 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeflP08551 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeflP08551 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeflP08551 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeflP08551 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeflP08551 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NeflP08551 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NeflP08551 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NeflP08551 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NeflP08551 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NeflP08551 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NeflP08551 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NeflP08551 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NeflP08551 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NeflP08551 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeflP08551 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeflP08551 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeflP08551 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeflP08551 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeflP08551 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NeflP08551 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeflP08551 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NeflP08551 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms