Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgamP05555 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgamP05555 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgamP05555 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgamP05555 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgamP05555 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgamP05555 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgamP05555 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ItgamP05555 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms