Protein–RNA interactions for Protein: P05367

Saa2, Serum amyloid A-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa2P05367 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa2P05367 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa2P05367 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa2P05367 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Saa2P05367 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa2P05367 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Saa2P05367 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms