Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hbb-bh1P04444 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hbb-bh1P04444 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms