Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-Eb1P04230 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms